يختلف توفر الموليبدينوم عن غيره من العناصر الصغرى تبعاً لدرجة حموضة التربة (pH). فهو يكاد لا يتوفر في الترب الحمضية، بينما يصبح شديد الذوبان في الترب القلوية ويمكن أن يتحرك فيها. كما أن الكميات المطلوبة منه منخفضة جداً، ولذلك يتطلب تطبيقه دقةً واعتدالاً في الجرعات.
يلعب الموليبدينوم دورًا في الآليات الإنزيمية المرتبطة بشكل خاص بـ استيعاب النيتروجين (إنزيم النيتروجيناز وإنزيم مختزل النترات). لذلك يُعد من العناصر الأساسية التي تساهم في تحويل النيتروجين داخل النبات إلى صورة قابلة للاستخدام.
يمتص النبات الموليبدينوم عبر محلول التربة على هيئة أيون سالب (أنيون).
يعمل الموليبدينوم بشكل جيد مع الفوسفور. أما الكبريت فيُحدث تأثيرًا مُحمِّضًا في التربة مما يؤدي إلى تقليل إتاحة الموليبدينوم للامتصاص.
على عكس معظم العناصر الصغرى الأخرى، يرتبط الموليبدينوم بقوة بالحديد في الترب الحمضية ولذلك تكون إتاحته منخفضة جدًا. ومع ارتفاع pH يصبح الموليبدينوم أكثر ذوبانية، وتزداد قابلية امتصاصه من قِبل النبات بشكل واضح.
إن إضافة مادة عضوية طازجة تدعم إمداد Mo بشكل إيجابي. إلا أن الخث (peat) لا يحقق الفائدة نفسها لأنه يتكوّن في وسط حمضي. وعند دراسة الرسوم التي تُظهر أشكال Mo باختلاف pH، نلاحظ أن شكل MoO₄²⁻ يزداد بوضوح كلما ارتفع pH — وهذا هو الشكل الذي يمتصه النبات أساسًا.
يرتبط نقص الموليبدينوم غالبًا بنقص النيتروجين في البقوليات؛ لأن Mo ضروري لنشاط إنزيم النيتروجيناز ولتثبيت N₂. وفي حالة النقص قد تظهر أعراض عدم كفاية النيتروجين.
في النباتات الصليبية (Crucifer)، تتكون لُطخ كلوروزية رمادية بين العروق، وتصبح أنسجة الورقة رخوة. وفي حالات النقص الشديد قد تتشوه الأوراق بالكامل.
تؤدي زيادة الموليبدينوم إلى حجب النحاس، وقد تسبب نقصًا في الحبوب ومحاصيل الأعلاف. كما أن النباتات المحبّة للحموضة (مثل المطاط) حساسة لزيادة الموليبدينوم.
لا تُجرى تحاليل الموليبدينوم في التربة بشكل روتيني. وتكون الترب الفقيرة بـ Mo والغنية بالحديد أكثر عرضة لنقص Mo.
في ظروف pH المنخفض، قد يقلل ارتفاع المادة العضوية من خطر النقص. فالإضافات المنتظمة للمادة العضوية يمكن أن توفر Mo ذائبًا. لكن إضافة الخث قد تسبب احتجاز Mo في الأحماض الهيومية — وبالتالي تقل إتاحته.
تزيد درجات الحرارة المرتفعة فوق 25°C من ذوبانية Mo، بينما تقلل الظروف الجافة من قابليته للامتصاص.
أكثر عامل حاسم لامتصاص Mo هو pH. فكلما ارتفع pH أصبح الموليبدينوم أكثر حركة في التربة.
يسهل الفوسفور امتصاص الموليبدينوم ونقله. لكن زيادة الحديد تحد من امتصاص Mo. كما أن زيادة النحاس أو تطبيقات Cu تقلل امتصاص Mo. وبالمثل فإن زيادة المنغنيز تؤثر سلبًا.
تختلف كمية Mo في التربة بشكل كبير تبعًا لبنية الصخر الأم، ومحتوى الحديد، ومستوى الحموضة. وبوجه عام، يكون Mo أكثر قابلية للامتصاص في الترب القلوية، وعالية المادة العضوية، والترب الفتية ذات الأصل البركاني.
أما في الترب الغنية بالحديد، فعادةً ما يكون مستوى Mo منخفضًا.