يرتبط المغنيسيوم غالباً بمشكلات جودة المحاصيل، ويرجع ذلك على الأرجح إلى العلاقة بين المغنيسيوم والبوتاسيوم. ويُدرك مربو الحيوانات أن نقص المغنيسيوم في العلف يزيد من مخاطر الإصابة بالتتانيا أو قابلية التعرض للعدوى. كما يلعب المغنيسيوم دوراً مهماً في تغذية النبات. يتمثل النشاط الرئيسي للمغنيسيوم في النباتات داخل البلاستيدات الخضراء حيث تتم عملية التمثيل الضوئي، أي في الكلوروفيل. ولذلك فهو يؤثر بشكل مباشر في الخصائص الفسيولوجية للنباتات وفي قدرتها على التقاط الكربون من الهواء وتحويله إلى صورة عضوية لإنتاج الكتلة الحيوية.
يشارك المغنيسيوم في النبات في العديد من الوظائف الأيضية (مثل تكوين الكربوهيدرات والبروتين) وفي آليات النقل. وتتمثل أهم أدواره في وجوده في مركز جزيء الكلوروفيل في الأوراق وارتباطه المباشر بعملية التمثيل الضوئي. يؤدي نقص المغنيسيوم إلى الكلوروز (الاصفرار) ويخفض الإنتاجية. كما أن نقص المغنيسيوم في محاصيل العلف قد يؤثر سلبًا على تغذية الحيوانات.
تكون كمية المغنيسيوم التي تنتشر من المعادن إلى محلول التربة محدودة نسبيًا. وإذا كان معقّد الطين–الدبال مشبعًا بالفعل بالكالسيوم أو البوتاسيوم، فإن Mg يؤدي دورًا أكثر ثانوية داخل هذا المعقّد. ويستهلك النبات طاقة لامتصاص المغنيسيوم عبر الجذور؛ أي أن امتصاص Mg لا يكون في الغالب سلبيًا بل يتم عبر النقل النشط.
العامل الأكثر حسماً في اختلالات الامتصاص هو نسبة K₂O/MgO. يجب الحفاظ على هذه النسبة تقريبًا عند مستوى 2:1. وإذا تجاوزت النسبة 3:1، فيجب اتخاذ إجراءات تصحيحية بالتأكيد.
ملاحظة: إذا عُبّر عن النسبة على أنها K/Mg، فإن المجال الأمثل يكون تقريبًا بين 0,8 و1,2.
قد تكون للمغنيسيوم الموجود في التربة مصادر مختلفة: نارية، رسوبية بحرية و عضوية. وبمجرد ذوبانه في محلول التربة يصبح المغنيسيوم حساسًا للغسل (leaching)، مما يسهم في خسائر Mg السنوية. كما أن المغنيسيوم عامل يؤثر أيضًا في قيمة pH التربة.
1. تُعد إعادة تدوير العناصر الغذائية الموجودة في السماد الحيواني وبقايا النباتات والمنتجات الثانوية العضوية الناتجة عن الأنشطة البشرية مصدرًا مهمًا للأسمدة من ناحية المغنيسيوم أيضًا.
2. يوجد المغنيسيوم في الدولوميت—وهو حجر جيري صلب يُستخرج من المحاجر— على هيئة كربونات المغنيسيوم. كما يمكن الحصول عليه من المناجم تحت الأرض على شكل أكسيد أو هيدروكسيد أو كبريتات المغنيسيوم (kieserite).
3. ينشأ Mg²⁺ المذاب في التربة من المغنيسيوم المتحرر من معقّد التبادل الطيني–الدبالي.
4. يجب أخذ انتقال المغنيسيوم المذاب إلى الطبقات العميقة مع فائض ماء التربة (الغسل) بالحسبان عند إعداد خطة التسميد.
5. يؤدي الجريان السطحي والتعرية إلى نقل المغنيسيوم المرتبط بالجسيمات الصلبة خارج الحقل.
6. لا تستطيع جذور النبات امتصاص المغنيسيوم إلا على هيئة Mg²⁺ المذاب في محلول التربة.
7. يُزال المغنيسيوم من الحقل مع الحصاد، وبالأخص على هيئة منتجات غذائية وأعلاف.
في تحاليل التربة يُحدَّد المغنيسيوم بوصفه مغنيسيومًا قابلاً للتبادل (exchangeable) ويُقاس بطرائق استخلاص متشابهة بين المختبرات. ويُقيَّم المستوى الأمثل للمغنيسيوم بربطه بسعة التبادل الكاتيوني (CEC)، ويستهدف أن تكون نحو %6 من CEC مشغولة بـ Mg²⁺. لذلك يلزم معرفة قيمة CEC أيضًا لتحديد قدرة التربة على توفير المغنيسيوم بدقة.
يؤثر نقص المغنيسيوم أولًا في الأوراق المسنّة. وعادةً ما تُرى بقع كلوروزية (مصفرة) بين العروق. وإذا طال النقص، تصبح أطراف الأوراق نخرية وتجف. وبوجه عام تقل كمية الكلوروفيل وعدد البلاستيدات الخضراء في النبات؛ ما يخفض القدرة على التمثيل الضوئي ويؤثر سلبًا في الإنتاجية.
قد تظهر زيادة المغنيسيوم خصوصًا عندما يتم تسميد غير متوازن بين المغنيسيوم والبوتاسيوم كما كان يحدث في السابق. وفي تحاليل التربة إذا انخفضت نسبة K₂O/MgO إلى أقل من 1، فيوصى بزيادة التسميد بالبوتاسيوم. وبذلك يُستعاد توازن المغنيسيوم–البوتاسيوم.
يُعدّ المغنيسيوم عنصرًا وفيرًا جدًا في طبقة الوشاح الواقعة تحت القشرة الأرضية. ويُعتبر البريدوتيت من أكثر صخور النظام الشمسي شيوعًا، وهو صخر يحتوي على أكثر من %40 سيليكات وأكثر من %40 مغنيسيوم.
يوجد المغنيسيوم أيضًا في الترب ذات الأصل الرسوبي البحري: على هيئة كربونات (كالدولوميت) أو على هيئة كبريتات (كالكيسيريت). ويتم الحصول على المغنيسيوم المستخدم في إنتاج الأسمدة أساسًا من هذين المصدرين.
يجب أن يكون محتوى المغنيسيوم الكافي في التربة، محسوبًا على هيئة MgO، ضمن نطاق 120–200 ppm. وتشير القيم الأقل من 120 ppm إلى أن التربة فقيرة بالمغنيسيوم، أما أقل من 80 ppm فتُعد غير كافية للغاية.
إن كون نسبة K₂O/MgO أعلى من 2 يقلل من إتاحة المغنيسيوم للنبات في التربة. وإذا تجاوزت النسبة 3 يظهر خطر حجب شديد وقد يُعيق امتصاص Mg بدرجة كبيرة.
تزيد الترب الرملية من خطر غسل المغنيسيوم. وبسبب انخفاض سعة التبادل الكاتيوني، ينتقل Mg²⁺ بسهولة أكبر إلى أعماق مقطع التربة.
بعد الشتاء، وخصوصًا عقب الفترات الممطرة، قد تكون إتاحة المغنيسيوم محدودة؛ ويرجع ذلك جزئيًا إلى الغسل وجزئيًا إلى التغيرات في حرارة التربة والنشاط الحيوي.
عندما ترتفع قيمة pH فوق 7,5 يزداد خطر نقص المغنيسيوم بسبب تشبع معقّد الطين–الدبال. ومن ناحية أخرى، عندما ينخفض pH إلى أقل من 5,5 تقل إتاحة Mg أيضًا. أي أن امتصاص المغنيسيوم قد يواجه مشكلات في الظروف شديدة الحموضة وكذلك في الظروف القلوية الزائدة.